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磁珠法核酸提取的原理跟硅膠膜離心柱相同。
主要是通過運用納米技術對超順磁性納米顆粒的表面進行改良和表面修飾后，制備成超順磁性氧化硅納米磁珠。
該磁珠能夠在微觀界面上與核酸分子特異性地識別和高效結合。
利用二氧化硅包被的納米磁性微球的超順磁性，在Ｃｈａｏｔｒｏｐｉｃ鹽（鹽酸胍、異硫氰酸胍等）和外加磁場的作用下，能從血液、動物組織、食品、病原微生物等樣本中分離出ＤＮＡ和ＲＮＡ。
簡單來說，磁珠法核酸提取的過程主要是裂解——結合——洗滌——洗脫。
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